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请注意，同一药物不同名称的剂型和剂量可能不同： 参见免责声明
在免疫功能正常的患者中，传染性软疣无需治疗。如果发生耻辱感、焦虑、传染风险或不适，建议治疗。[11]
如果疾病带来性传播疾病 (STD) 方面的公共卫生问题，在成人中可能偶尔需要使用侵袭性破坏疗法。一线治疗方法包括麻醉或不麻醉下刮除术，或者局部破坏性方法例如冷冻治疗。
当皮损有症状或者要求治疗皮损时可使用。一些青少年和成人可忍受不局麻情况下进行刮除术。
刮除术是以观察性研究为基础的长期存在的疗法。清除皮损导致所有被治疗的皮损完全清除，这是有益的。不幸的是，旧的皮损被清除后新的皮损可继续发生。
像任何破坏性疗法一样，存在一些风险包括过度流血、疼痛、刺痛、点状瘢痕（少见），色素沉着（常见于深色皮肤的人）和正在愈合伤口的感染，由于刮除术引起的伤口很表浅，感染很少见。
潜在特应性皮炎和细菌双重感染应该在开始任何软疣治疗前进行治疗。
冷冻治疗 : 所有可见皮损均可用液氮；4-6 周后新的或残留的皮损可重复治疗
或
斑蝥素外用 : 药物需要由药剂师配置合成，因为它没有作为一种专有药品。应限于经过恰当使用技术培训的皮肤科医生使用。
羟基乙酸外用 : 由于它不是一种专有药物，需要由药剂师配制合成
或
咪喹莫特外用 : (5%)用于感染部位每周 3-7 次，停留在皮肤上 6-10 小时然后洗掉
或
维甲酸外用 : （0.1% 乳膏或者 0.025% 凝胶）应用于患处，每日 1 次或每周 3 次夜间棉签外用
或
局部水杨酸/乳酸 : 由于它不是一种专有药物，需要由药剂师配制合成
或
局部氢氧化钾 : 由于它不是一种专有药物，需要由药剂师配制合成
对成人的治疗是与 STDs 有关的公共健康问题，而且可能需要积极使用破坏疗法。这种方法提供一种备选一线疗法，当损伤出现症状或者期望治疗皮损时被推荐使用。局部外用药以一种比刮除术更缓和的方式清除皮损。
冷冻治疗采用液氮，使软疣囊壁表面起水疱，释放内容物并可愈合。液氮被推荐用于成人治疗。不良反应包括局部刺痛。
在美国，用含小量 0.7% 斑蝥素的弹性火棉胶已经被描述用于治疗儿童非面部的软疣。斑蝥素，一种引起水疱的药物，是被批准用于合成的原料药。它不是作为一个专有的产品，而且需要由药剂师专门合成。限于经过恰当使用技术培训的皮肤科医生使用。
其他药物逐渐剥脱皮损表面角质形成细胞，同样地释放内容物。这些平缓的治疗方法包括化学剥脱药物例如α-羟基酸（例如羟基乙酸），β-羟基酸（例如水杨酸）和维甲酸（例如维 A 酸凝胶）。维 A 酸很少被使用，因为这种药物清除作用很慢。它可以在家晚上的时间用棉棒外用。在英国，羟基乙酸不可用。
外用咪喹莫特尽管不是普遍有效但是已经在双盲安慰剂对照的试验中被证实优于安慰剂[19]被推荐用于没有明显皮肤敏感的患者。这种药物在 HIV 阳性个体中也有效。一项研究评估了成年女性在使用 5% 咪喹莫特治疗生殖器软疣 16 周后的反应。72% 女性皮损清除，44% 女性完全清除。[20]5% 咪喹莫特和 10% 氢氧化钾[12]经比较并证实清除软疣皮损是有效的和安全的，尽管咪喹莫特不如KOH 有效。KOH 制剂需要由药剂师进行而且应该在专家监督下使用。[21]证据 C在一项针对儿童的比较性临床试验中，KOH 10% 在统计学上的有效性高于局部外用咪喹莫特。[22]另一种治疗选择是局部外用水杨酸和乳酸溶液 (16.7%) 长达 6 周；[13]这也需要由药剂师配制合成。
所有这些药物均可引起刺激、水疱、不适和可能的继发瘢痕或者色素沉着或感染。
潜在特应性皮炎和细菌双重感染应该在开始任何软疣治疗前进行治疗。
这种疗法仅被描述为用于儿科软疣；然而，没有生物学原因表明成人中它不会同样有效。
硬化剂是引起皮损血供破坏的疗法。同时，只有脉冲染料激光因相同目的被处方(585nm;595nm)。[15]脉冲染料激光释放一缕烟柱包含病毒 DNA（对操作者有害的感染。如果患者 HIV 阳性要使用烟疏散和口罩过滤来保护操作者。似乎除了暂时局部紫癜，无严重后遗症记载。激光机器昂贵而且可能引起局部不适，所以应该限于二线疗法。
潜在特应性皮炎和细菌双重感染应该在开始任何软疣治疗前进行治疗。
针对经选择患者组全部患者的治疗推荐
西多福韦外用 : (3%)咨询药剂师；由于它不是一种专有产品需要被专门合成。
鬼臼根树脂外用 : (15%)临床上用棉签外用于感染部位，每周 1 次（最大量 0.5ml）而且 1-6 小时后洗掉；咨询专家以进一步指导使用剂量
或
鬼臼毒素外用 : （0.5% 或 0.15%），在家中用于感染部位，每日 2 次（最大量 0.5ml）3 天后洗掉，间隔一周后可重复治疗，总疗程 5 周
外用抗病毒药物：只有外用 3% 西多福韦已经被证实有特殊抗软疣病毒效果。[16]尚无可获得的外用药物，而且由于静脉内产品的成本很高导致该复合混合物昂贵。因此，广泛应用受到限制。
免疫功能受损患者可能有大的软疣和与天花类似的严重的点状瘢痕。
外用抗有丝分裂药物：化疗或抗有丝分裂药物可以外用，但只有鬼臼根树脂已被证实用于软疣。
外用鬼臼根树脂可在临床上用于软疣，但皮损清除是最小的。在家里，用鬼臼毒素对软疣治疗是有效的。[17]
刺激、局部糜烂或者溃疡、疼痛、压痛和炎症后色素沉着均可发生于这种疗法。应该避免在神经上直接使用。
在免疫功能受损患者中使用还没有被很好的评估。
禁用于共济失调毛细血管扩张症。
潜在特应性皮炎和细菌双重感染应该在开始任何软疣治疗前进行治疗。
儿童的主要治疗方法是不治疗除非发生不适症状或双重感染。所有具有免疫能力的儿童最终可清除皮损，所以用严酷的或严重的治疗是不需要的。在有免疫活性的情况下，感染的自然病程是 2-4 年自发清除，在免疫功能受损情况下病程更长。
当皮损有症状或者要求治疗皮损时可使用。
刮除术是以观察性研究为基础的长期存在的疗法。清除皮损导致所有被治疗的皮损完全清除，这是有益的。不幸的是，旧的皮损被清除后新的皮损可继续发生。
像任何破坏性疗法一样，存在一些风险包括过度流血、疼痛、刺痛、点状瘢痕（少见），色素沉着（常见于深色皮肤的人）和正在愈合伤口的感染，由于刮除术引起的伤口很表浅，感染很少见。
潜在特应性皮炎和细菌双重感染应该在开始任何软疣治疗前进行治疗。
针对经选择患者组全部患者的治疗推荐
利多卡因/丙胺卡因外用 : 参考产品资料以获取产品剂量信息
或
利多卡因外用 : 参考产品资料以获取产品剂量
局麻是近期加到刮除疗法中的。[23]推荐幼儿在刮除术前给予局麻。如果更小的儿童在治疗过程中不能坐，可能需要全麻。尽管麻醉，儿童仍能感到压力和刮除术的刮或者移除，引起他们痛苦。满意度调查证实父母对此疗法满意率较高。[24]
局部外用利多卡因和丙胺卡因低共熔混合物，高铁血红蛋白血症是一种特殊风险。一些患者外用利多卡因发生即时充血反应，这不是一种过敏反应。
外用麻醉膏后刮除皮损在欧洲很流行；然而，出于同一目的这一方法在英国并没有被广泛应用。
潜在特应性皮炎和细菌双重感染应该在开始任何软疣治疗前进行治疗。
针对经选择患者组全部患者的治疗推荐
斑蝥素外用 : 不作为一种专有产品，需要由药剂师专门合成；限于经过恰当使用技术培训的皮肤科医生使用
或
咪喹莫特外用 : 咨询专家以指导用量
羟基乙酸外用 : 咨询药剂师：由于它不作为一种专用药品需要被专门合成；这种产品不适用于家庭使用
或
维甲酸外用 : （0.1% 乳膏或 0.025% 凝胶）用于感染部位，每日 1 次或每周 3 次夜间用棉签使用；推荐家庭使用
外用药物可被临床或家庭使用；这些适用于较小的还不能坐的儿童的临床治疗，因为他们以比刮除术更温和的方式清除皮损。
咪喹莫特被证实能有效清除皮损。证据 C尽管冷冻治疗比咪喹莫特更便宜更快，但它可能需要看更多次门诊。
在儿童中，斑蝥素是推荐选择的药物，尤其是不能忍受疼痛的幼儿。一项儿童皮肤科临床斑蝥素治疗 300 例儿童的病例系列证实药物治疗 95% 有效率而且是一项治疗软疣最大的病例系列。[6]特别注意不要将斑蝥素与鬼臼根树脂或水杨酸联合使用，会引起更大的和更不舒服的水疱。
斑蝥素，一种引起水疱的药物，是被批准的原料药。它不是作为一个专有的产品，而且需要由药剂师专门合成。限于经过恰当使用技术培训的皮肤科医生使用。
其他药物包括α-羟基酸（例如羟基乙酸），β-羟基酸（例如水杨酸）和维甲酸（例如维 A 酸凝胶）。维甲酸和羟基乙酸很少被推荐用于儿童，因为疗程长和很多局部副作用，如红斑、发红、刺激或瘙痒。在英国，羟基乙酸不可用。
所有这些药物可引起刺激、水疱、不舒服和可能继发瘢痕、色素沉着或感染。
潜在特应性皮炎和细菌双重感染应该在开始任何软疣治疗前进行治疗。
硬化剂是引起皮损血供破坏的疗法。同时，只有脉冲染料激光因相同目的被处方(585nm;595nm)。[15]脉冲染料激光释放一缕烟柱包含病毒 DNA（对操作者有害的感染。如果患者 HIV 阳性要使用烟疏散和口罩过滤来保护操作者。除了暂时的局部紫癜，没有严重的后遗症。激光机器昂贵而且可能引起局部不适，所以应该限于二线疗法。
潜在特应性皮炎和细菌双重感染应该在开始任何软疣治疗前进行治疗。
针对经选择患者组全部患者的治疗推荐
西多福韦外用 : (3%)咨询药剂师；由于它不是一种专有产品需要被专门合成。
鬼臼根树脂外用 : (15%)临床上用棉签外用于感染部位，每周 1 次（最大量 0.5ml）而且 1-6 小时后洗掉；咨询专家以进一步指导使用剂量
或
鬼臼毒素外用 : （0.5% 或 0.15%），在家中用于感染部位，每日 2 次（最大量 0.5ml）3 天后洗掉，间隔一周后可重复治疗，总疗程 5 周
外用抗病毒药物：只有外用 3% 西多福韦已经被证实有特殊抗软疣病毒效果。[16]尚无可获得的外用药物，而且由于静脉内产品的成本很高导致该复合混合物昂贵。因此，广泛应用受到限制。
免疫功能受损患者可能有大的软疣和与天花类似的严重的点状瘢痕。
外用抗有丝分裂药物：化疗或抗有丝分裂药物可以外用，但只有鬼臼根树脂被处方用于软疣。
外用鬼臼树脂可在临床上用于软疣，但皮损清除是最小的。在家里，用鬼臼毒素对软疣治疗是有效的。[17]
刺激、局部糜烂或者溃疡、疼痛、压痛和炎症后色素沉着均可发生于这种疗法。应该避免在神经上直接使用。鬼臼根树脂联合会引起水疱的药物例如水杨酸或斑蝥素，不被推荐用于小儿童，因为这会增加严重不良事件的可能性。用组合产品治疗的儿童中已见到有神经病的发生。
在免疫功能受损患者中使用还没有被很好的评估。
禁用于共济失调毛细血管扩张症。
潜在特应性皮炎和细菌双重感染应该在开始任何软疣治疗前进行治疗。
咪喹莫特外用 : (5%)用于感染部位，每周 3-7 次，停留在皮肤上 6-10 小时然后洗掉
或
西咪替丁 : 30-40mg/kg/d， 分 3 次口服 6-12 周
外用一氧化氮释放器 : 咨询药剂师：它不作为一种专有产品，需要被专门合成。
免疫调节剂通常只用于病程长的患者或者有大量皮损的患者，这些会妨碍有效的临床治疗。病程长的或泛发性的疾病可能是免疫功能受损的一个征象。有证据表明免疫调节剂在免疫缺功能受损者中发挥作用，使这些成为移植和 HIV 患者最初的治疗选择。
外用咪喹莫特尽管不是普遍有效但是已经在双盲安慰剂对照的试验中被证实优于安慰剂[19]被推荐用于没有明显皮肤敏感的患者。这种药物在 HIV 阳性个体中也有效。一项研究评估了成年女性在使用 5% 咪喹莫特治疗生殖器软疣 16 周后的反应。72% 女性皮损清除，44% 女性完全清除。[20]5% 咪喹莫特和 10%KOH 进行比较并证实能有效且安全的清除软疣皮损，但是咪喹莫特有效性差于 KOH。[21]证据 C
口服免疫调节剂（例如西咪替丁）也可能有效
如果疾病对咪喹莫特抵抗或患者使用了可能与西咪替丁相互作用的药物治疗，应考虑应用局部一氧化氮释放器[26]
潜在特应性皮炎和细菌双重感染应该在开始任何软疣治疗前进行治疗。
HIV 患者中，HAART 疗法是一种大剂量抗逆转录疗法，已经被证实有益于软疣皮损的清除。[18]
由于疗法各异，应该咨询专家或 HIV 药物治疗指南指导剂量。
西咪替丁 : 30-40mg/kg/d ，分 3 次口服 ，持续6-12 周
外用一氧化氮释放器 : 咨询药剂师：它不作为一种专有产品，需要被专门合成。
口服免疫调节剂（例如西咪替丁）可能有效，尤其在伴发特应性皮炎的儿童。病程长或泛发疾病可能是免疫缺陷的一个征象。
免疫调节剂通常只用于病程长的患者或者有大量皮损的患者，这些会妨碍有效的临床治疗。证据基于一个小型病例系列分析。[9]西咪替丁被认为在儿童软疣中有效。如果患者正在进行其它可能与西咪替丁相互作用的药物治疗，局部一氧化氮释放应该作为次选。
这些干预有利于调节免疫系统抵抗软疣病毒。然而，像所有免疫疗法一样，免疫系统需要 3-6 周开始起效而且需要 6-12 周完成清除。
局部一氧化氮释放通过增加局部血流调节免疫系统，促进免疫细胞归巢至软疣皮损。小儿童可能的不良反应包括高铁血红蛋白血症。
潜在特应性皮炎和细菌双重感染应该在开始任何软疣治疗前进行治疗。
HIV 患者中，HAART 疗法是一种大剂量抗逆转录疗法，已经被证实有益于软疣皮损的清除。[18]
由于疗法各异，应该咨询专家或 HIV 药物治疗指南指导剂量。
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