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氟康唑 : 400 mg，口服/静脉输注，每日一次，持续 3-6 个月
或
伊曲康唑 : 200 mg，口服，每日两次，连服 3-6 个月
进行密切的临床、血清学及放射学随访后，如果症状随时间推移而加重，则应考虑以唑类抗真菌药（如氟康唑或伊曲康唑）进行治疗。[4]
氟康唑 : 400 mg，口服/静脉输注，每日一次，持续 3-6 个月
或
伊曲康唑 : 200 mg，口服，每日两次，连服 3-6 个月
应对有感染播散危险因素的患者（非裔美国人、菲律宾人、免疫功能受损患者或糖尿病患者）采用临床、血清学及放射学随访进行密切监测，或可采用氟康唑或伊曲康唑预防性治疗。[4]
氟康唑 : 400 mg，口服/静脉输注，每日一次，持续 3-6 个月
或
伊曲康唑 : 200 mg，口服，每日两次，连服 3-6 个月
两性霉素-B 脂质体复合物 : 2-5 mg/kg，静脉使用，每日一次，持续 1-6 个月
或
脂质体两性霉素 B : 2-5 mg/kg，静脉使用，每日一次，持续 1-6 个月
或
两性霉素 B 脱氧胆酸盐 : 每日 0.5-1.5 mg/kg，静脉输注，每日一次或隔天一次，持续 1-6 个月
重度症状包括持续 2 个月以上的症状、体重减轻 10% 以上，盗汗持续 3 周以上，广泛性肺浸润（双侧患病、持续性肺门淋巴结肿大）、无法工作、年龄 ＞ 55 岁及血清学滴度 ＞ 1:16。[4]
治疗的目标是尽快控制感染并（理想情况下）防止形成肺外感染病灶。[4]不治疗的风险包括进展性肺感染和肺外感染，可能导致严重疾病或死亡。
患者可每天采用氟康唑或伊曲康唑进行治疗，持续治疗 3-6 个月。[4]如果采用唑类抗真菌药治疗后患者的症状并未得到改善，则可改用两性霉素 B。[4]
对于持续性治疗，推荐唑类抗真菌药疗法。因此，如果开始时使用的是两性霉素 B，则可在数周后或患者症状稳定时改用氟康唑或伊曲康唑。
在其他方面健康（非免疫抑制）的无症状患者中，若球孢子菌病（由细针穿刺活组织检查或结节切除术等非侵入性或侵入性手段诊断）导致的结节在放射学照片上显示稳定（并未随时间推移而增大），则无需治疗。[4]
如胸部 X 线检查可发现并测得异常，则无需进一步影像学检查。如需更精确或胸部 X 线检查无法发现异常，则建议 CT 扫描。
第一年可每 3-4 个月随访一次，随后第二年每 6 个月随访一次。如果放射学检查确信稳定，该病变则无需长期随访。
氟康唑 : 400-800 mg，口服/静脉输注，每日一次，持续治疗，直到可见临床或血清反应
或
伊曲康唑 : 200 mg，口服，每日两次，持续治疗，直到可见临床或血清反应
球孢子菌肺结节如开始增大则应通过血清学和痰培养进行评估，以评定是否为活动性感染。如为活动性感染，则推荐采用氟康唑或伊曲康唑进行治疗。[4]
氟康唑 : 400-800 mg，口服/静脉输注，每日一次，至少治疗 1 年或直到可见临床或血清反应
或
伊曲康唑 : 200-400 mg，口服，每日两次，至少治疗 1 年或直到可见临床或血清反应
伏立康唑 : 6 mg/kg，静脉输注，每 12 个小时一次，两剂，随后 4 mg/kg，每 12 个小时一次
或
泊沙康唑 : 400 mg，口服（混悬液），每日两次
或
两性霉素-B 脂质体复合物 : 2-5 mg/kg，静脉使用，每日一次
或
脂质体两性霉素 B : 2-5 mg/kg，静脉使用，每日一次
或
两性霉素 B 脱氧胆酸盐 : 每日 0.5-1.5 mg/kg，静脉输注，每日一次或隔天一次
初始治疗包括氟康唑或伊曲康唑，可减轻症状并预防进一步感染和纤维化以及肺功能进行性下降。持续治疗 12 个月或直到看到反应。[4]
如果初始治疗无效，可增加剂量、改用伏立康唑或泊沙康唑（已有研究报告二者对传统治疗无效的选定患者有效）等替代性唑类药物，[29][30][31][32][33][34]或改用两性霉素 B。[4]
氟康唑 : 起始剂量为 400 mg，口服/静脉输注，每日一次，持续治疗直到可见临床或血清学反应，根据患者反应增加至每日 800 mg
或
伊曲康唑 : 起始剂量为 200 mg，口服，每日两次，持续治疗直到可见临床或血清学反应，根据反应增加至 400 mg，每日两次
伏立康唑 : 6 mg/kg，静脉输注，每 12 个小时一次，两剂，随后 4 mg/kg，每 12 个小时一次
或
泊沙康唑 : 400 mg，口服（混悬液），每日两次
或
两性霉素-B 脂质体复合物 : 2-5 mg/kg，静脉使用，每日一次
或
脂质体两性霉素 B : 2-5 mg/kg，静脉使用，每日一次
或
两性霉素 B 脱氧胆酸盐 : 每日 0.5-1.5 mg/kg，静脉输注，每日一次或隔天一次
治疗是为了减轻症状、控制感染并限制组织和器官功能损害。[4]皮肤和软组织感染的治疗反应率通常介于 25%-91%，复发率高达 50%。[35]
初始治疗应包括氟康唑或伊曲康唑。[4]持续治疗，直到临床上和血清学检测时看到反应，这个过程会历时数月到几年。治疗停止后，需密切随访以监测是否复发。
如果初始治疗无效，可增加剂量、改用伏立康唑或泊沙康唑（已有研究报告二者对传统治疗无效的选定患者有效）等替代性唑类药物，[29][30][31][32][33][34]或改用两性霉素 B。[4]
伊曲康唑 : 起始剂量为 200 mg，口服，每日两次，持续治疗直到可见临床或血清学反应，根据反应增加至 400 mg，每日两次
或
氟康唑 : 400-800 mg，口服/静脉输注，每日一次，持续治疗，直到可见临床疗效
伏立康唑 : 6 mg/kg，静脉输注，每 12 个小时一次，两剂，随后 4 mg/kg，每 12 个小时一次
或
泊沙康唑 : 400 mg，口服（混悬液），每日两次
或
两性霉素-B 脂质体复合物 : 2-5 mg/kg，静脉使用，每日一次
或
脂质体两性霉素 B : 2-5 mg/kg，静脉使用，每日一次
或
两性霉素 B 脱氧胆酸盐 : 每日 0.5-1.5 mg/kg，静脉输注，每日一次或隔天一次
骨骼球孢子菌病是一种慢性进展性感染。[36]可给予治疗以限制受累骨骼和邻近结构（肌肉、关节、支撑结构）破坏并限制功能丧失。
氟康唑和伊曲康唑在治疗骨骼球孢子菌病方面的比较证实伊曲康唑稍优。[37]如果患者对伊曲康唑耐受良好，初始治疗则应包括该药物。氟康唑是一种替代性药物。
如果初始治疗无效，可增加剂量、改用伏立康唑或泊沙康唑（已有研究报告二者对传统治疗无效的选定患者有效）等替代性唑类药物，[29][30][31][32][33][34]或改用两性霉素 B。[4]
氟康唑 : 400-800 mg，口服/静脉输注，每日一次，持续治疗，直到可见临床疗效
或
伊曲康唑 : 200 mg，口服，每日两次
伏立康唑 : 4 mg/kg，口服/静脉输注，每 12 小时一次
两性霉素 B 脱氧胆酸盐 : 咨询会诊医生以指导鞘内给药
可给予治疗，以减轻症状、控制感染、限制组织和神经系统功能损害及预防脑积水。[4]
氟康唑是首选疗法，但伊曲康唑亦有疗效。[4][38]如果这两种治疗均无效，则推荐伏立康唑。唑类药物治疗需无限期持续。[4]
如果患者对唑类药物治疗无反应，则应考虑给予鞘内两性霉素 B (ITAMB)。[4][38]ITAMB 可并发两性霉素 B 脱氧胆酸盐神经毒性和治疗应用并发症（如脑池出血或 Ommaya 储液囊细菌感染）。[38]
两性霉素-B 脂质体复合物 : 2-5 mg/kg，静脉使用，每日一次
或
脂质体两性霉素 B : 2-5 mg/kg，静脉使用，每日一次
或
两性霉素 B 脱氧胆酸盐 : 每日 0.5-1.5 mg/kg，静脉输注，每日一次或隔天一次
罹患轻度或消退性疾病的妊娠患者可进行密切观察，无需治疗。需进行系列评估以重新评价是否需要治疗。
可给予治疗以减轻重度症状、控制感染及预防肺外感染播散。治疗效果较差与妊娠后期诊断相关。[8]
妊娠患者具有播散性感染风险。然而，与其他患者组的治疗不同，唑类药物不作为一线疗法，因为大部分唑类药物被标为妊娠 C 类或 D 类且已有致胎儿畸形的报告。[8]因此，如果发现潜在益处大于风险，则可给予两性霉素 B。[4]
婴儿分娩后，结合有效的避孕方法可将治疗更改为氟康唑或另一种唑类药物。
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