亚急性和慢性疾病较为少见。当间歇性接触中等水平的抗原时,可发生亚急性疾病:例如,在屋顶漏水(可滋生嗜热放线菌)的屋子里。亚急性过敏性肺炎患者在抗原暴露后数周或数月可能会因呼吸困难、排痰性咳嗽和不适等症状(与抗原暴露没有时间关系)而就诊。慢性疾病患者的抗原暴露水平低,数月至数年后才会发病。例如,一名患者住在楼上公寓内,与一家专营鸟类的宠物店共用一套通风系统。在公寓居住几年后,该过敏性肺炎患者出现含糊、隐匿的症状,例如呼吸困难、体重减轻、不适和咳嗽。约半数此类过敏性肺炎患者有杵状指。[7][8]
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