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可切除性取决于肿瘤大小、边缘特征、包裹良好，以及症状（缺乏肿瘤早期阶段的症状）。对于出现上腔静脉综合征的患者，一线疗法是潜发性肿瘤必不可少的治疗方法。
临床上带包膜的胸腺瘤根据病理诊断和治疗而被切除。[25]为降低复发风险，必要进行总胸腺切除术（胸腺完整切除）。应实现肉眼下切除边缘无肿瘤。手术发病率和死亡率通常较低。
病理报告和外科医生的看法可确定辅助纵隔放疗的必要性。
Masaoka I 期肿瘤（带包膜的肿瘤，无侵袭证据）近乎全部切除，且不需要任何辅助疗法。
Masaoka II 期肿瘤（肉眼及镜下有侵袭，但未侵犯至纵隔胸膜）通常全部切除。但有关是否需要辅助放疗尚存在争议。当确定辅助疗法的必要性时，完整切除与否和外科医生的观点依然是考虑的主要决定因素。
Masaoka III 期肿瘤（侵犯至邻近组织）可能不能完整切除，而且通常切除边缘会非常狭小。因此考虑到不能完整切除，大部分 III 期肿瘤患者均接受辅助放疗，因为这些肿瘤在生理上具有侵略性，而且几乎没有切除空间（不可避免）。[28]然而，尚无确凿的证据表明术后放疗可降低复发风险。
顺铂 : 咨询专家以指导剂量
和
多柔比星 : 咨询专家以指导剂量
和
环磷酰胺 : 咨询专家以指导剂量
或
顺铂 : 咨询专家以指导剂量
和
依托泊苷 : 咨询专家以指导剂量
或
顺铂 : 咨询专家以指导剂量
和
长春新碱 : 咨询专家以指导剂量
和
多柔比星 : 咨询专家以指导剂量
和
环磷酰胺 : 咨询专家以指导剂量
一旦确定局部晚期胸腺瘤或胸腺癌，患者通常要化疗。[29][30][31][32]常采用的化疗方案包括：顺铂-多柔比星-环磷酰胺、顺铂-依托泊苷，以及顺铂-长春新碱-多柔比星-环磷酰胺。[32]化疗的疗效为 40%-100% 不等，而已观察到完全缓解率为 6%-40%。20%-80% 接受诱导化疗的患者可实现完全切除。
有时候，很大程度上基于偏好不同，可见肿瘤诱导化疗结合放疗。[33]
患者通常在手术前接受 2-6 周期的诱导治疗。然后根据再行的胸部 CT，重新评估患者肿瘤的切除性。
切除术后，大部分患者会接受辅助纵隔放疗或联合术后放疗和化疗，因为一些不能切除的或部分切除的肿瘤可能受益于联合疗法。
顺铂 : 咨询专家以指导剂量
或
紫杉醇 : 咨询专家以指导剂量
或
依托泊苷 : 咨询专家以指导剂量
或
环磷酰胺 : 咨询专家以指导剂量
或
多柔比星 : 咨询专家以指导剂量
或
长春新碱 : 咨询专家以指导剂量
或
异环磷酰胺 : 咨询专家以指导剂量
或
培美曲塞 : 咨询专家以指导剂量
或
奥曲肽 : 咨询专家以指导剂量
复发相关的最重要因素包括：Masaoka 分期、WHO 组织学分型，以及切除的完整性。
胸腺瘤往往在胸部复发，通常位于胸膜（局部复发 87% 及远处复发 13%），而胸腺癌往往在远处转移复发，尤其是肺、骨骼、大脑和肝脏（远处复发 60% 及局部复发 40%）。[3][9][10][35]
远处复发通常接受化疗治疗。活性较好的化疗药物包括顺铂、紫杉醇、依托泊苷、环磷酰胺、多柔比星、长春新碱、异环磷酰胺及奥曲肽。[37]也可采用联合化疗，这样会更加敏感。
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