检查
首要检查
全血细胞计数 (FBC)
一项常规检测。白细胞计数增多见于多数感染性病因导致的脑炎。白细胞水平下降和全血细胞减少常见于 HIV 和使用免疫调节/免疫抑制药物的患者。
淋巴细胞相对增多可见于病毒性脑炎。立克次体热和病毒热与白细胞和血小板减少有关。
嗜酸性粒细胞增多症见于某些寄生虫感染（浣熊拜林蛔线虫）。
常有白细胞增多
外周血涂片
如果怀疑患有疟疾，最好能在患者发热高峰时收集血液进行涂片检查，以提高发现滋养体的可能性。这在疟疾流行地区是至关重要的。埃立克体病患者的单核细胞内可见细胞质包涵体。
检测恶性疟原虫和埃立克体
血清电解质
一项常规检测。低钠血症见于立克次体感染和抗利尿激素分泌异常综合征 (SIADH)、抗电压-门控钾通道 (VGKC) 相关性脑炎。
低钠血症
肝功能检查
贝氏柯克斯体、立克次体、蜱传疾病、巨细胞病毒、埃博拉病毒。
升高
血液培养
应作为发热性疾病常规检查的一部分。很少进行虫媒病毒培养，只能通过专门的参比实验室进行。
用于全身性细菌感染和大多数虫媒感染的检测和确诊
咽拭子
通过咽拭子标本培养（以及一些抗原检测）来检测肠病毒、脊髓灰质炎病毒、巨细胞病毒、腺病毒、腮腺炎、麻疹、流感和副流感病毒。
可检测病毒
鼻咽分泌物
常用于有呼吸道症状的儿童（成人不常用）。
可检测呼吸道病毒；通过 PCR 来确定腺病毒或流感病毒
痰培养
用于发热性疾病和有肺部症状或体征的患者。
可检测支原体、结核病（抗酸染色）和真菌感染
胸片
作为发热性疾病检查的常规项目。可以检测支原体、军团菌、副流感、结核病、球孢子菌、组织胞浆菌、酵母菌病、贝氏柯克斯体或结节病。
可检测非感染性或感染病因（例如结核病、结节病）所导致的病变
脑部 CT
因应用广泛，且对不配合的患者容易操作，多作为一种筛查工具。应安排所有精神状态改变的患者进行该项检查。造影后 CT 扫描（如可能）可见弥漫性脑膜强化，这通常是脑炎的表现。
单纯疱疹病毒性脑炎：通常为正常或轻度异常。之后可见导叶、岛叶出现低密度病灶和占位效应，以及出血和强化。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 单纯疱疹病毒性脑炎患者的普通头部 CT：左侧岛叶出现轻微高密度影。灰质与白质边界模糊，可见左颞区脑沟消失源于 Catalina C. Ionita 医生的个人收藏 [Citation ends].
HIV-1：正常/轻度萎缩，可见低密度脑白质病变。机会性感染和艾滋病病毒 (HIV) 感染的并发症都有特征性表现。
急性播散性脑脊髓炎 (ADEM)：40%正常；可见不对称的絮状低密度病灶，增强后可见多处病灶出现点状或环形强化。
阿米巴：弥漫性水肿。
脑炎患者在病程早期通常表现正常，但也可能出现许多明显的改变
脑部 MRI 扫描
怀疑脑炎时强烈推荐（最好是在开始时）此项检查，它具有十分重要的诊断意义。[1][32]大多数患者可见早期病变的异常信号。但是与 CT 相比，MRI 在实际应用中相对较少，而且为了获得高质量的图像，患者可能需要使用镇静剂。
单纯疱疹病毒性脑炎：T1 加权像显示脑回水肿，T2、 FLAIR 和 DWI（表观扩散系数 [ADC] 图显示弥散性增加）显示颞叶和扣带回高信号。
HIV：T2 和 FLAIR 图像显示脑组织萎缩以及非特异性白质高信号。机会性感染和艾滋病病毒 (HIV) 感染的并发症都有特征性表现。
脊髓灰质炎和柯萨奇：中脑和脊髓前角出现 T2 高信号。
埃博拉病毒：基底神经节、丘脑和小脑出现 T2 高信号。
水痘带状疱疹病毒：白质和灰质高信号。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 前五幅图像是水痘带状疱疹病毒性脑膜脑炎患者的 FLAIR 图像，表现为白质和灰质高信号。最后一个是造影后的 T1 图像，可见脑实质和弥漫性软脑膜强化源于 Eric E. Kraus 的个人收藏 [Citation ends].
西尼罗河病毒脑炎：脑室周围的软脑膜强化。
日本脑炎：双侧丘脑、脑干和小脑 T2 高信号。
急性播散性脑脊髓炎 (ADEM)：T2 /FLAIR 图像显示双侧白质和灰质出现大片多灶性不对称的高信号。造影后的 T1 图像可见环形强化的病变。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 急性播散性脑脊髓炎患者脑部 MRI 扫描系列图像：液体衰减反转恢复 (FLAIR) 图像显示高信号病灶，累及左小脑脚源于 Catalina C. Ionita 医生的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 急性播散性脑脊髓炎患者脑部 MRI 扫描系列图像：双侧脑室角和丘脑非对称性的“绒毛样”病灶源于 Catalina C. Ionita 医生的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 急性播散性脑脊髓炎患者脑部 MRI 扫描系列图像：脑室周围源于 Catalina C. Ionita 医生的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 急性播散性脑脊髓炎患者脑部 MRI 扫描系列图像：半卵圆中心源于 Catalina C. Ionita 医生的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 急性播散性脑脊髓炎患者脑部 MRI 扫描系列图像：钆增强 T1 图像，显示右侧半卵圆中心区周围环形强化，该区域上方轻度弥散加强源于 Catalina C. Ionita 医生的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 急性播散性脑脊髓炎患者脑部 MRI 扫描系列图像：同一个患者的 DWI 图像，显示同一区域高信号，弥散加强（表观弥散系数图亮区）源于 Catalina C. Ionita 医生的个人收藏 [Citation ends].
拉斯穆森脑炎：皮质和白质可见 T2 高信号、额叶-岛叶区域皮质萎缩、侧脑室扩大、尾状核中度萎缩，所有改变都局限于一侧大脑半球。
克雅二氏病：苍白球、丘脑和皮质（皮质带）可见 T2/FLAIR 高信号和/或 DWI 改变。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 脑部 MRI 扫描：克雅二氏病患者的 DWI 图像显示枕症（是指双侧丘脑后结节高信号的术语）源于 Leo H. Wang 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 脑部 MRI 扫描：克雅二氏病患者 DWI 图像的皮质表现源于 Leo H. Wang 的个人收藏 [Citation ends].
副肿瘤边缘叶脑炎：内侧颞叶双侧受累，FLAIR 和 DWI 显示多灶性病变。
表现取决于病因；常见高信号病灶（T2 和液体衰减反转恢复 [FLAIR] 序列），弥散加权成像 (DWI) 如显示弥散加强则提示脑水肿，如 T1 序列图像在造影后显示强化则提示血脑屏障破坏
脑电图 (EEG)
背景活动慢化是与大脑疾病有关的早期的敏感指标，但特异性极低，尤其是对于使用了镇静剂的患者。
颞叶异常常见于病毒性脑炎。
单纯疱疹病毒脑炎患者可见颞叶重复性的尖波和复合波，或单侧定期癫痫样放电 (PLED)。[33][34]
亚急性硬化性全脑炎中，可见典型的广泛性周期性的脑电图改变，间隔 4 至 15 秒重复出现，患者同时伴有肌阵挛。[34][35]
克雅二氏病发现：高振幅周期性 (1 Hz) 复合物。
常有背景活动慢化
脑脊液 (CSF) 分析
对几乎所有怀疑脑炎的患者都要进行腰穿 (LP)，前提是通过影像学检查排除脑部占位性病变，且没有禁忌症（例如，凝血功能障碍，包括病毒性出血热引起的血小板减少，针头穿刺部位皮肤感染等）。只有在异常情况下才考虑推迟腰椎穿刺。
脑脊液静水压：病毒性脑炎患者的脑脊液静水压通常是正常的，但也可能升高，尤其是存在脑膜脑炎时。
颜色和透明度：可变，一般情况下为透明的，某些坏死性和出血性脑炎（单纯疱疹病毒脑炎，急性出血性脑白质炎，李斯特菌和原发性阿米巴脑膜脑炎）患者可呈淡黄色或微带有血色。
蛋白质：多数病毒性脑炎患者正常或轻度升高。细菌感染、自身免疫性疾病、边缘叶脑炎和急性播散性脑脊髓炎患者可表现为中度升高。结核病和结节病显著升高。
葡萄糖：病毒性脑炎（除了腮腺炎，淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒感染，HSV-1 的晚期阶段）患者通常正常或处于正常低值。细菌、真菌和寄生虫和肿瘤性病因所导致的脑炎也可表现为低血糖。
细胞计数：在没有穿刺创伤的情况下，红细胞计数通常是正常的。单纯疱疹病毒脑炎（占 40%）、急性出血性脑白质炎、李斯特菌和原发性阿米巴脑膜脑炎患者可见红细胞＞500/mm^3。多数情况下白细胞升高，说明存在脑实质脑炎，脑膜脑炎或脑膜脑炎。在疾病早期可能是正常的，[36][37][38]因免疫功能受损而无法实现正常的炎症反应的患者也可能表现正常。[39]病毒性脑炎患者最初可见多形核 (PMN) 为主，24 至 48 小时后转变为单核细胞（西尼罗河病毒感染除外）。淋巴细胞（病毒、结核）；非典型淋巴细胞（见于埃博拉病毒和巨细胞病毒感染，单纯疱疹病毒脑炎中少见）；PMN 白细胞增多（见于细菌性感染、急性播散性脑脊髓炎、急性出血脑白质炎、阿米巴感染，在某些病毒感染患者中少见，如西尼罗河病毒）。嗜酸粒细胞增多（结核病、真菌感染、浣熊拜林蛔线虫、广州管圆线虫、颚口虫）。
脑脊液中蛋白＞1.0 g/L，或脑脊液中葡萄糖＜2/3 外周葡萄糖，或脑脊液淋巴细胞增多伴亚急性症状，提示存在结核病或真菌感染。
脑脊液中蛋白＞1.0 g/L，或脑脊液中葡萄糖＜2/3 外周葡萄糖，且中性粒细胞增多伴急性症状和近期使用抗生素，提示存在肺炎链球菌或脑膜炎双球菌感染。
结果取决于病因；白细胞计数 (WCC) 可能升高，蛋白正常/升高，血糖正常/降低，红细胞 (RBC) 正常/升高
脑脊液培养
培养：在确定细菌和真菌的病因时非常有用。只对少数病毒（腮腺炎、肠道病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒）感染有用。病毒培养很少呈阳性，如为阴性，也不能排除感染。
抗原检测：在快速鉴别脑炎细菌和真菌的病因时非常有用。
革兰氏染色：检测细菌病原体。
抗酸染色：结核病。
印度墨汁染色：隐球菌。
结果取决于病因
脑脊液血清学检测
明确诊断需进行血清学检测，并将脑脊液和血清特异性抗体水平，以及脑脊液和血清的总白蛋白或总免疫球蛋白水平进行对比。对于病毒性感染，如急性期样本比恢复期样本的 IgG 水平升高 4 倍，或在急性期出现 IgM 阳性，则可确诊。[40][41]
结果取决于病因；检测虫媒病毒、HSV-1 和 HSV-2、VZV、CMV、EBV、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒、狂犬病、西尼罗河、腮腺炎和麻疹
脑脊液聚合酶链反应 (CSF PCR)
对于普通的病毒性脑炎，PCR 应作为脑脊液分析的一线筛查手段，并且基于危险因素、患者的接触情况和临床表现进行后续的定向 PCR 扩增。
结果取决于病因；病毒（肠病毒，脊髓灰质炎病毒、虫媒病毒、HSV-1、HSV-2、VZV、CMV、EBV、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒、腺病毒、麻疹病毒、HIV、狂犬病病毒）；细菌（肺炎支原体、结核杆菌）；真菌（隐球菌、曲霉病）
需要考虑的检查
尿液培养
尿液病毒培养不是常规检测。
可检测脊髓灰质炎病毒、水痘带状疱疹病毒、腮腺炎病毒和麻疹病毒
粪便肠病毒培养
如果儿童胃肠道症状先于脑炎出现，应更频繁地进行该项检测。粪便培养物也可用于检测脊髓灰质炎病毒。
可检测肠道病毒
IgG 和 IgM 抗体（血液）
怀疑病毒性脑炎时应进行该项检测。可通过血清学研究检测病毒病原体的特异性 IgG 和 IgM 抗体。
可检测肠道病毒、脊髓灰质炎病毒、虫媒病毒、水痘带状疱疹病毒、巨细胞病毒、埃博拉病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒 (LCMV)、流行性腮腺炎、麻疹、艾滋病、狂犬病和西尼罗河病毒的 IgG/ IgM 抗体
PCR（血液）
怀疑病毒性脑炎时应进行该项检测。
检测肠道病毒、脊髓灰质炎病毒、虫媒病毒、水痘带状疱疹病毒、巨细胞病毒、埃博拉病毒和艾滋病毒
HIV 血清学检测/RNA 检测
存在艾滋病病毒 (HIV) 感染风险的患者应进行该项检测。艾滋病毒可能会导致急性脑病，同时伴有血清转换。血浆病毒 RNA 定量检测用于确定急性逆转录病毒综合症（即艾滋病病毒抗体检测呈阳性之前有症状的患者）。机会性感染也可能导致 HIV 相关的脑炎。
艾滋病病毒 (HIV) 感染时呈阳性
脑脊液生物标志物/朊蛋白检测
怀疑朊病毒感染的患者应进行脑脊液 (CSF) 检测。生物学标志包括脑源性蛋白 (14-3-3, tau)；但是，应谨慎解读这些检测，因为在不同文献中，其敏感性和特异性存在差异。[30][31]实时震动诱导转化 (RT-QuIC) 使用扩增技术来检测朊病毒蛋白 (PrPSc)，灵敏度比生物标志物检测更高。[31]
14-3-3 蛋白升高、tau 蛋白升高；可检测朊蛋白
副肿瘤性抗体（血液和脑脊液）
怀疑有癌症时可进行。
可见副肿瘤性抗体，如抗 N-甲基-D-天冬氨酸 (NMDA) 受体，抗电压-门控钾通道，抗 Hu、抗 Yo、抗 Ri、抗 Tr、抗 CV2、抗 Ma、抗两性蛋白抗体
全身 CT
如疑似有和边缘叶脑炎或脑干脑炎相关的癌症（例如肺癌、乳腺癌或卵巢癌），应将该项检查作为患者病程后期临床检查的一部分。
检测潜在的癌症
全身 PET 扫描
如疑似有和边缘叶脑炎或脑干脑炎相关的癌症（例如肺癌、乳腺癌或卵巢癌），应将该项检查作为患者病程后期临床检查的一部分。
检测潜在的癌症
磁共振波谱分析
只用于专科研究中心。可用于临床诊断为脑炎，但病因不明确的患者，或怀疑为脑炎，但无法与脑肿瘤进行鉴别的患者。
代谢数据有助于识别病因
新一代脑脊液测序
只用于专科研究中心。使用个性化基因组来诊断感染的病因。[29]和对一些选定数量的目标片段进行定向 PCR 扩增不同，现在的技术已经可以全面地检测病原体。病原体的 DNA 被分离后，S16 核糖体 RNA 基因通过通用引物进行扩增，并进行测序。然后将该序列与 100,000 多个已公布的序列进行比较，从而确定病原体。
可检测和鉴定病原体
脑活组织检查
可以用于确诊。不常规使用，因为属于侵入性操作，且需要全身麻醉，还可能导致一些并发症。目前 MRI 和基于 PCR 的诊断方法得到越来越广泛的应用，对脑活组织检查的需要正在减少。但在其他手段难以确诊时，该方法仍是非常有用的。可对活检/尸检样本进行免疫细胞化学检测 (ICC)、原位杂交 (ISH) 和 PCR 检测，对脑炎的病因诊断有着深远的影响。
典型的脑炎结节由分布于受累神经元周围的小胶质细胞、星形胶质细胞和淋巴细胞组成的，
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 脑右颞叶活检：经典的 H＆E 染色显示脑实质中存在广泛的片状小单核细胞（淋巴细胞）炎性浸润，主要出现在血管壁周围。活检标本的 PCR 检测显示埃博拉病毒感染阳性源于 Catalina C. Ionita 医生的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 脑右颞叶活检：放大图片可见血管周围存在明显的炎症浸润。活检标本的 PCR 检测显示埃博拉病毒感染阳性源于 Catalina C. Ionita 医生的个人收藏 [Citation ends].细胞学特征，比如包涵体（单纯疱疹病毒脑炎和水痘带状疱疹病毒的细胞核内）、亚急性硬化性全脑炎和狂犬病毒细胞质的内格里氏小体。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 狂犬病患者的海马体活检显示，2 个神经元内有嗜酸性内格里氏小体（红色箭头）。往往在炎症反应较少的区域发现。蓝色箭头表示小胶质细胞源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 狂犬病患者的海马体活检显示，神经元内有嗜酸性内格里氏小体（红色箭头）。蓝色箭头表示卫星少突胶质细胞聚集源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 狂犬病患者的海马体活检显示，一个神经元内有嗜酸性内格里氏小体（红色箭头）。蓝色箭头表示血管旁小胶质细胞聚集源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].和巨细胞样改变 (CMV)。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 感染巨细胞病毒性脑炎的 HIV 患者脑干活检。室管膜显示细胞增大（箭头）和核内包涵体源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 巨细胞病毒脑炎新生儿大脑皮质活检发现，细胞增大（箭头）和核内包涵体。顶部的箭头指向一个双核且每个核内有一个核内包涵体的神经元。源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].急性播散性脑脊髓炎患者脑活检显示白质的小静脉周围排列着多发性小脱髓鞘病灶，伴有淋巴细胞、巨噬细胞和小胶质细胞浸润。隐球菌性脑膜脑炎活检可见隐球菌。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 患隐球菌性脑膜炎的免疫功能受损患者的脑活组织检查低倍镜下图片。脑膜扩大（箭头），但大脑皮质未出现明显的组织学改变源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 低倍镜下，免疫功能受损的隐球菌性脑膜炎患者脑活组织检查显示，脑膜部位存在半透明圆形隐球菌（红色箭头）和芽殖酵母（蓝色箭头）源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者脑活组织检查低倍镜下照片显示，脑膜部位存在炎症细胞（红色箭头）源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者活检显示，脑膜存在炎症细胞和隐球菌源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 隐球菌性脑膜炎患者脑膜活检（粘蛋白卡红染色）显示，存在真菌病原体，尤其是在巨细胞内源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 隐球菌性脑膜脑炎患者脑组织冠状切片显示，基底神经节（箭头）处可见“肥皂泡”结构的经典外观，是由隐球菌侵袭豆状核纹状体血管周围的 Virchow-Robbin 腔而导致的。源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 隐球菌性脑膜脑炎患者基底神经节活检显示：隐球菌侵袭豆状核纹状体血管（红色箭头）周围的 Virchow-Robbin 腔（蓝色箭头）。源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 隐球菌性脑膜炎患者大脑尸检：大脑表面呈“釉”样光滑的外观。还存在分流源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].HIV 病毒脑炎患者活检可见独特的多核巨细胞。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 亚急性 HIV 病毒性脑白质炎患者脑活组织检查显示：Virchow-Robin 腔中炎性细胞旁的白质中存在独特的多核细胞（红色箭头）。源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 亚急性 HIV 病毒性脑白质炎患者脑活组织检查显示：白质中存在独特的多核细胞（红色箭头）。源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 亚急性 HIV 病毒性脑炎患者脑活组织检查显示：独特的多核巨细胞（红色箭头），其中含有 HIV 病毒。多核巨细胞来自组织细胞/巨噬细胞系。还存在相关的星形胶质细胞增生源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 30 多岁的 HIV 患者的脑组织冠状切片。患者患有亚急性 HIV 性脑炎，弥漫性累及脑白质和脑灰质。脑室扩大，反映有白质和皮质缺失源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].在弓形体病中，生物体是可识别的。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: HIV 性弓形体病患者的大脑冠状切片显示，左侧丘脑脑室周围上部感染。源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: HIV 弓形体病患者的大脑活组织检查可见包囊裂殖子（红色箭头）和速殖子（蓝色箭头）源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: HIV 弓形体病患者的活检可见细胞碎片和速殖子。速殖子呈圆形，表面光滑，在没有抗体染色的情况下很难分辨（见下图）源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: HIV 弓形体病患者的活检照片显示，使用免疫组化法标记速殖子源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].克雅二氏病可见海绵样变性。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 克雅二氏病患者后侧丘脑活检：海绵样变性源于 Robert E. Schmidt 的个人收藏 [Citation ends].
脑实质损害（常见神经细胞损伤或死亡，最终出现脱髓鞘样变），胶质细胞反应性增生和炎症细胞浸润
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