诊断步骤
肝脓肿不是一种常见病。既往特征和体征经常是非特异性的。因此，在考虑到肝脓肿作为主诉症状的可能原因时，采用较低的标准是很重要的。肝脏影像学成像和脓肿积液培养是做出诊断和识别病原体的关键。
病史
胆道异常基础疾病、年龄大于 50 岁、恶性肿瘤、糖尿病以及胆道或肝脏的介入治疗是发生化脓性肝脓肿的密切相关危险因素。来自或去过阿米巴病疫区的患者发生阿米巴肝脓肿的风险更高。
化脓性脓肿最常见的症状是发热、寒战、疲劳、恶心、呕吐和腹痛。如果膈膜因为相邻感染发炎，那么可能出现咳嗽、呼吸短促和胸膜痛。在这些病例中，疼痛可牵涉到右肩尖。真菌性肝脓肿患者表现出类似的症状。患者通常有免疫功能受损或中性粒细胞减少。[17]通常在免疫系统恢复（中性粒细胞计数开始增加）时出现症状。
症状出现通常比较隐匿，可能是非特异性的，并且持续时间长短不一。阿米巴脓肿的症状与化脓性脓肿的类似，但更可能出现急性发病。[17]可能同时出现阿米巴病的其他症状，例如腹泻。特别重度感染（任何类型）的患者，可能也会更快出现症状。
查体
查体通常会发现发热、右上腹压痛和肝肿大。不过，即使没有出现这些表现，也不能排除肝脓肿的诊断。只有很少的肝脓肿患者出现黄疸，通常在疾病晚期出现。偶尔可能会出现胸腔积液，因而在常规的胸部查体时会发现叩诊浊音、呼吸音消失、触诊震颤减弱以及右下区声音传导减弱。罕见情况下，可能会出现腹水。重症（经常是菌血症或胆管炎）患者可出现休克体征。
实验室检查
疑似肝脓肿患者应接受基本的实验室检查，包括：
全血细胞计数 (full blood count, FBC)
血清白蛋白、氨基转移酶、胆红素和碱性磷酸酶水平
凝血酶原时间 (prothrombin time, PT) 和活化部分凝血活酶时间 (activated partial thromboplastin time, aPTT)
血液培养。
常见贫血、白细胞增多和中性粒细胞计数升高。大多数患者的肝生化检查结果（特别是碱性磷酸酶）异常。血清白蛋白通常较低。尽管这些发现提示患有肝病，但它们是非特异性的。在进行脓液抽吸前，进行 PT 和 aPTT 检测，以检查凝血功能是否在正常值范围内。在约一半患者中，血液培养可以发现病原体，如果怀疑肝脓肿，应进行此项检查。
如果怀疑阿米巴脓肿，血清学检查可能有诊断意义。有并存的腹泻时，采用溶组织内阿米巴酶免疫测定 (enzyme immunoassay, EIA) 可检测出粪便样本中溶组织内阿米巴的抗原。
C 反应蛋白 (C-reactive protein, CRP) 检测是一种非特异性检查，可用于监测炎症反应，因而可以监测对治疗的反应。[23]
影像学检查
首选的初步影像学检查是腹部增强 CT 扫描和腹部超声检查。[24]MRI 对小脓肿的敏感性高于超声检查和 CT，但价格昂贵，并且可用性更为有限。CT 对肝脓肿的敏感性高于超声 (＞ 95% vs 86%-90%)。通常进行 CT 扫描。有时超声扫描和 CT 扫描一起进行：例如，如果初步超声检查不能确定，或者尽管结果是阴性，但是强烈怀疑肝脓肿。超声或 CT 都可用于指导抽吸可疑积液。超声的好处是广泛可用、成本低且无需使用造影剂。CT 可以详细检查肝脏的相邻器官。在超声或 CT 扫描上，脓肿通常被显示为右侧（最常见）积液伴周围水肿。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 一位 46 岁男性出现发热、疲劳和咳嗽，CT 扫描显示肝脓肿 (7 cm x 5 cm)选自马萨诸塞总医院收集的放射影像学图像 [Citation ends].
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 一位 46 岁男性出现发热、疲劳和咳嗽，CT 扫描（冠状面）显示肝脓肿选自马萨诸塞总医院收集的放射影像学图像 [Citation ends].
在进行脓液抽吸前，检查所有凝血参数是否在正常值范围内很重要。抽吸脓肿积液可确认脓肿诊断，并指导抗生素治疗。然而，培养现有引流样本对指导抗微生物治疗没有帮助。[25]应对积液进行革兰氏染色，并进行需氧菌和厌氧菌培养。
依据病灶抽出液，可确认阿米巴脓肿诊断，但可能没有必要。抽出物通常是红棕色的黏性液体（“鯷鱼酱”或“巧克力酱”）。[17]肝脓肿积液抗原检测或肝脓肿脓液聚合酶链反应（polymerase chain reaction, PCR；通常在参考实验室中进行）可用于确诊阿米巴肝脓肿。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 阿米巴肝脓肿大体病理学；试管内盛有脓肿的“巧克力”样脓液美国疾病预防控制中心 (CDC)/ Dr.Mae Melvin；来自亚拉巴马州莫比尔的 Dr. E. West [Citation ends].
如果有凝血功能异常的证据，应避免抽吸/采样。疑似包虫囊肿也是禁忌证，因为存在严重过敏反应的风险，该风险虽然低，但确实存在。然而，当仍有可能诊断为阿米巴肝脓肿，或者抽吸是治疗的一部分时，可偶尔对包虫病疑诊患者进行抽吸。抽吸只能由具有操作经验的医生在专门治疗此类患者的医疗中心进行。
如果检查时有任何胸部症状或体征（例如，提示膈膜刺激的症状或胸膜腔积液体征），还需要进行胸部 X 线检查 (chest X ray, CXR)。
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