病因学
大多数自然流产见于妊娠早期，＜3% 发生于妊娠中期。[9]病因可以分为胚胎因素和/或母体因素，但更有可能是多种原因影响。
胚胎因素：
大多数孕早期流产（6 至 12 周）可归因为原发性胚胎疾病、紊乱或损害。[15]
孕早期流产的早期妊娠组织中，多达 80% 有染色体异常。[16]复发性流产的早期妊娠组织中，染色体异常的比率更高。[17]尽管认为非随机 X 染色体失活是一种特异性遗传病因，但多项研究结果不支持这一观点。[18][19]一项研究发现，与三级女性亲属相比，若一级女性亲属曾经发生过自然流产，那么流产的风险可能加倍。因此，自然流产家族史阳性可能是复发性自然流产的一个原因；但需要进一步研究。[20]
胚胎畸形，尤其是中枢神经系统，常见于自然流产的妊娠。
母体因素：
许多孕中期流产（13 至 22 周）是由于母体生殖道功能障碍或全身疾病。有人提出，绝大多数病例与来自下生殖道的上行性感染有关。如果在当地和大区的妊娠结局数据中得到证实，那么就需要明显改变预防和先发制人的策略。[21]
母体暴露于高剂量毒性物质、辐射或化疗、严重的内分泌病变、免疫系统疾病、跨胎盘感染可能有关。[6]无症状的细菌性阴道病可能是孕中期流产的重要因素。[22][23]较大的黏膜下子宫肌瘤会损害早期胚胎血管生成和微血液动力学。抗磷脂抗体综合征可能引起孕早期和孕中期复发性流产。[24]宫颈机能不全、宫颈弛张症或宫颈口闭锁不全是多数复发性孕中期流产的原因。既往连续多次妊娠早产。
一项关于已发表的孕妇服用草药/传统药物的研究的综述发现，有些药物可能有堕胎性质，包括芦荟、苦柠檬和芹菜。[25]尚不清楚使用这些药物，结合药物相互作用和患者异质性如何影响早期妊娠结局。因而，很明显需要进一步研究。
使用一个预测模型，纳入的变量包括 11 至 14 周之间单胎妊娠中的颈后透明带、妊娠相关性血浆蛋白 A 和母体特征（比较了相同孕周接受绒毛膜绒毛采样的 2396 例孕妇和没有接受采样的 33,856 例孕妇），结果发现，促排卵所致妊娠、颈后透明带厚的婴儿以及在孕前有糖尿病的妇女，流产风险增加。[26]
母体所患疾病的严重程度、正在接受的治疗和其他混杂因子可能比疾病本身更重要。
在实践中，孕中期流产的前 5 位原因是有创性胎儿诊断操作后的宫颈机能不全、宫颈弛张症或宫颈口闭锁不全；经胎盘胎儿病毒感染；经胎盘胎儿细菌感染；重度同种异体免疫反应。
病理生理学
分类
世界卫生组织 (WHO) 自然流产阶段分类[1]
分为以下几类：
先兆流产：当发生不明原因阴道出血伴有或不伴有下腹痛时存在的流产危险，见于＜22 孕周妊娠（妊娠可能继续）。
难免流产：如果存在特异性临床特征，表明妊娠处于从宫腔内往外的生理性排出过程中，则认为是难免妊娠（妊娠不会继续，将发展成完全或不完全流产）。
不完全流产：早期妊娠组织被部分排出的流产。许多不完全流产可能是未被识别的稽留流产。
完全流产：早期妊娠组织被完全排出的流产。
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: 流产的自然进程来自：Ankum WM, Wieringa-de Ward M, Bindels PJE.BMJ, 2001; 322:1343-1346。 [Citation ends].
其他流产类型
稽留流产（早期胚胎/胎儿死亡）：[3]
超声特征符合非存活或非持续妊娠的流产，即使不存在临床特征。早期妊娠组织可能被部分排出。稽留流产通常是偶然发现，因为很少有迹象表明妊娠出问题。有些妇女确实想起曾有短暂和/或棕色的阴道分泌物，或早孕反应似乎曾经减轻。
复发性自然流产：[3]
连续≥3 次在满 22 孕周之前妊娠自然丢失，被视为复发性自然流产。
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