肺结核

非典型肺炎的体征有捻发音和呼吸困难。与肺结核相比，症状持续时间一般更短。如果不能排除肺炎，应给予抗细菌的治疗并观察治疗反应（不要使用喹诺酮类和其他有抗结核活性的抗生素）。

痰检查确认除正常菌群外是否存在细菌。

结核和肺癌可以共存：恶性肿瘤可以破坏肉芽肿结构。即便痰抗酸杆菌染色阳性时，如果病变特点提示癌症（例如不规则空洞）或在抗结核治疗中肺部病变进展，需要进一步进行评估。[33]Garay SM. Pulmonary tuberculosis. In: Rom WM, Garay SM, eds. Tuberculosis. 2nd ed. New York: Lippincott, Williams & Wilkins; 2003:345-394.

痰细胞学；胸部 CT；组织活检

鸟分枝杆菌复合群和堪萨斯分枝杆菌均可以表现为空洞病变。 结核的高危因素可能有助于诊断。

如果痰抗酸杆菌培养阳性，DNA 探针可以用来进行菌种鉴定。同样地，如果涂片阳性但核酸扩增试验检查阴性，则结核分枝杆菌感染可能性较小。非结核分枝杆菌最常见于有肺部基础病的患者。

可能的真菌感染包括组织胞浆菌病、球孢子菌病和芽生菌病。旅行史可能有助于缩小鉴别诊断的范围。

痰真菌培养和血清真菌抗体阳性有助于真菌感染的诊断，结核分枝杆菌感染则呈现阴性结果。

结节病可以出现胸内淋巴结病变和关节痛等其他特点

结节病中痰培养往往是阴性